2006年于5月13日至6月28日间，所在组合举行了在日本的首次巡回演唱会“Heart， Mind and Soul TOUR ”，此次演唱会走过了大阪，横滨，福冈，名古屋，东京，新泻等日本著名的7所城市，共演出11场，公演人数为15000人。
2007年3月，组合推出10th单曲《Choosey Lover》，并第八次进入公信榜周榜前十位。随后，在日本发行了 《2nd Album -Five in the Black》，并于5月10到6月19日举办了第二次日本巡回演唱会“FIVE IN THE BLACK TOUR” 。此次演唱会辗转10个城市共16场公演，观看人数约为58000人。
2013年1月，沈昌珉加盟KBS 《月光王子》成为固定MC，在播出近2个月之后因收视率停播。同时，所在组合首次在香港举办演唱会“World Tour ‘Catch Me’香港站‘’，沈昌珉更是用普通话深情演绎了张惠妹的《听海》。15日，沈昌珉代表组合出席2013亚洲模特颁奖典礼并受赏。3月。所在组合发行日本六辑《TIME》，获公信榜月榜冠军。4月，沈昌珉加盟成为KBS《我们小区艺体能》的固定MC，该综艺自开播以来连续占据周二综艺收视率第一。且不到1年播放权就销往日本。同时，所在组合举办日本五蛋巡回演唱会。8月，成为第一个在日产体育馆举办演唱会的韩国团体，合计动员85万人次，更新自身保持的海外艺人在日本公演动员数纪录。同时，凭借《拥抱黄金飞翔》，沈昌珉荣获第36届日本电影金像奖新人演员奖，第67回日本放送映画艺术大赏映画部门优秀新人奖，以及22回日本映画批评家大赏最佳新人赏。10月，该电影在韩国上映。此外，沈昌珉参与了SHINee新专辑收录曲《无法离开（Sleepless Night）》的词创作。12月，沈昌珉凭借《我们小区艺体能》，获得第12届KBS演艺大赏最佳艺人奖。
2014年1月，所在组合东方神起凭借韩国第七张正规专辑《TENSE》连续两周获得韩国唱片销量榜冠军，并取得美国billboard world album排行榜排名第二、世界专辑销量排行榜United World Chart排名第三的好成绩。沈昌珉参与了该专辑收录的抒情歌曲《RISE...》的词创作，传达着即便遭遇困难的事情,等时间过去,也能战胜一切的治愈讯息。2月，沈昌珉参与了东方神起第七张后续专辑《入迷（Spellbound）》中的PB R&B曲风的个人solo曲《Heaven's Day》的词创作。同时，加入了SM公司的限定企划S.M THE BALLAD，并与Krystal参与了该企划第二张专辑收录曲《Breath》日文版的演唱。20日，Mnet企划推出的四集金耀剧《美美》首播，沈昌珉在其中饰演男主角韩珉宇一角，该剧讲述了超越时空，改变命运的男女之间唯美凄凉的初恋故事。27日，和文佳英携手为时尚杂志《THE CELEBRITY》拍摄了一组写真，再现了唯美且充满神秘感的初恋气氛。28日，所在组合凭借多个音乐作品在日本第28届金唱片大赏连获五项大奖。3月，发行的《MIMI》幕后花絮DVD（《Mimi スペシャルプレビューDVD》）获得日本公信榜DVD综合部门周榜一位，这也是韩国电视剧继裴勇俊的《太王四神记プレビューDVD 金盘》（2007年3月）后第二次获得该部门周榜一位。同时，所在组合发行的日本第六张专辑《Tree》以超过25万张的月销量夺得了日本公信专辑榜月销量冠军。4月至6月，所在组合东方神起举行了第七次日本巡回演唱会“东方神起 LIVE TOUR 2014~TREE~”，在日本全国各地举行共29场次，吸引了60万余名观众，刷新了在日本的海外艺人新纪录。演唱会期间，沈昌珉主演的电视剧《美美》被剪辑为上下两部剧场版在日本30家影院上映，剧场版门票首周破万，是2007年之后最高的韩流明星售票记录。8月，沈昌珉参与了李泰民solo专辑收录曲《Ace(王牌)》的词创作和歌曲和声部分的演唱。9月3日，其为MBC月火剧《巡夜人日志》演唱的OST《无法说爱你》的音源也通过各音乐网站公开，该曲讲述了对于旧爱的迷恋之情。17日，沈昌珉前往巴厘岛为时尚杂志《Cosmopolitan》韩国版10月号拍摄了以“自然”为主题的写真，展现自由奔放的面貌。26日，沈昌珉与演员具惠善共同出演了BeatBurger第一张迷你专辑主打歌《She So High》的MV，在MV中出演男主角，与女主展现了恋人之间难分难舍的演技。同日发行的《MIMI》完整版DVD（《MIMI》 コンプリートエディションDVD）登上了日本最大唱片销量Oricon排行榜的电视剧榜单和综合榜单榜首。11月，沈昌珉参与了曹圭贤的solo专辑收录曲《我的思维,你的记忆 (My thoughts, Your memories)》的词创作。
